Приоритеты заповедной науки

Социальные взаимоотношения между лисицей обыкновенной и барсуком обыкновенным.

Многолетние изменения гидролого-гидрогеологических объектов на территории заповедника (озеро Карасун, река Горькая, водно-солевой режим, уровень воды, пересыхание в летний сезон, влияние этих факторов на экосистемы).

Экологическое состояние туристических троп (влияние антропогенного фактора на состояние флоры и фауны).

Оценка состояния популяции волка.

Оценка состояния популяции желтого и малого сусликов, их взаимоотношения.

Изменения во взаимоотношениях с другими видами птиц Орлана-белохвоста, особенности гнездования.